相比于科尔沁、内喀尔喀、土默特这些至少还尊奉大汗的漠南蒙古诸部，统治漠北的外喀尔喀五部做的更绝。
林丹巴图尔继位时，外喀尔喀五部的汗，公开宣称蒙古帝国衰落已久，蒙古大汗早不是蒙古诸部的共主，拒不尊奉。
相反，这外喀尔喀五部，有四家都与新兴的建州女真，还有同建州和亲的科尔沁部来往密切。
漠西方向，卫拉特部也是一样，公开宣称黄金家族实力不再，察哈尔部虽然还是大部，但其实力却不足以统治整个蒙古。
林丹巴图尔继位之初，号称强权的大明帝国，还没有在萨尔浒之战中失败，依然足以威慑整个蒙古。
那个时候的建州女真，已经开始尝试与科尔沁、外喀尔喀等部和亲，漠南蒙古起初对建州十分鄙视。
但是自从萨尔浒之战，大明惨败以后，漠南第二个大部科尔沁部的意见来了个翻天覆地的变化。
他们去向努尔哈赤请罪，请求他赦免他们曾随同大明、叶赫等攻击建州的错误决定。
为了诚意，科尔沁部提出愿意同建州永世盟好，主动缔结姻亲。
从那个时候起，林丹汗的处境就很艰难了，因为他发现，不仅外喀尔喀五部，即便是奉自己为共主的漠南诸部，也开始倒向建州。
林丹巴图尔是一个有野心的人，他甚至还曾在萨尔浒之战前夕，接受万历皇帝的建议，以蒙古帝国大汗的身份，给努尔哈赤最后通牒。
他警告建州，不得侵犯大明的疆域，否则，察哈尔部将联合蒙古诸部，讨伐建州。
然而，林丹巴图尔的确没想到。
不仅他失败了，就连当时聚集重兵出关，刚刚打完抗倭援朝战争的大明，也遭到了惨败。
当然，在林丹汗看来，这无异于被努尔哈赤“啪啪”打脸。
身为骄傲的黄金家族后裔，一代天骄的直系子孙，林丹巴图尔无法容忍努尔哈赤，这个曾经的李成梁手下贱奴，爬到自己堂堂蒙古大汗的头上拉屎。
自那时候起，林丹巴图尔与努尔哈赤，便是不共戴天的仇人。