大明首都北迁后，南京附近的皇庄由于缺少皇族就近照应，所以两百多年下来，早就被地方豪强官绅给吞得差不多了。待得朱由栋准备南下时，万历皇帝叫来内官监的太监让其清查皇家在南直隶还有多少皇庄的时候，发现只剩下了七个皇庄，总共土地面积不到一万亩。
长叹了一口气的万历大手一挥：孙儿，这七个皇庄都给你了。你想怎么处置就怎么处置。
朱由栋来到南京后，首先需要解决的是生产基地和研发中心的问题。
医学研发中心暂时设在皇城里是可以的，但是火药、枪械、钢材、机械、化学、光学等诸多研发中心就必须要找远离城市的地方。但是呢，这些研发中心又不能离南京城太远，如此，朱由栋才能充分发挥穿越者的优势，时时亲临指导：具体操作他是做不了什么的，但至少可以保证大方向不会出错，科技树不会点歪。
所以，他的目光就定在了南京城南三十里的方山。
这山不高，海拔也就两百多米。但幅员较广，整个山体面积大约8.6平方公里。